山楂為淺根性樹種，主根不發達，但生長能力強，在瘠薄山地也能生長。側根的分布層較淺，多分布在地表下30～60厘米土層內，深可達90厘米，10厘米以上和90厘米以下土層內的根量很少。側根主要分布在40厘米左右的土層內，根系的水平分布范圍，約為樹冠的2～3倍。

山楂苗定植后，當年發根較晚。因此，定植當年地上部生長較弱，第2年緩苗后，長勢轉旺，以后便一年比一年旺。但修剪時不能因長勢旺而大甩大放，甚至連延長枝也不剪，這樣會影響樹體結構和骨架牢固，影響枝組的合理分布，雖然可能提早結果，但結果面積小，產量低。

山楂的根系常發生不定芽，形成根蘗苗，且多發生在5～20厘米的表層土壤中。可用于繁殖苗木或更新。

（2）山楂的頂端優勢強于蘋果、梨樹

因其頂端優勢強，所以，樹冠內部的中、短枝和小枝組的壽命相對較短，結果后很易衰亡。頂端優勢越強的樹，內膛光禿的現象也越嚴重。所以修剪時應注意抑制頂端優勢，維持樹冠內膛枝組的健壯生長。抑制頂端優勢的常用方法，是加大骨干枝的開張角度。頂端優勢減弱以后，內膛的中、短枝轉化力增強，副芽和隱芽也可能萌發新枝，利用這些枝條培養結果枝組，可使內膛充實、豐滿，擴大結果面積，提高果實產量