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火龍果莖枯病由有性態的球腔菌屬和無形態的莖點霉屬(Phoma sp)寄生引起，主要危害火龍果肉質莖，病菌隨病莖在地表越冬，翌年3月溫度達到5℃時，病菌開始活動，15℃時散發抱子侵染火龍果肉質莖，其發病適溫為20^300C。分生抱子器隨雨水滴濺或空氣傳播進行再侵染。

其病害發生部位是火龍果的肉質莖。開始時出現乳白色小斑點，以后逐漸擴大成不規則形病斑，無明顯邊緣，稍凹陷，邊緣黃色，中央灰白色，上面附著黑色小粒點。

火龍果莖枯病一般在3月下旬開始發病，此期病害才剛開始見病，病株率尚低，病情發展緩慢。從4月上旬開始，病害開始加重。5月中旬至7月中旬為發病盛期，此時正值火龍果開花期，由于氣溫升高，加上雨季來臨，給病害發生創造了非常有利的條件，使病害在田間迅速蔓延造成病害大發生。

11月下旬以后進入越冬階段。全年發病高峰時間是6月底至7月初，田間病株率達20%以上，給火龍果生產造成嚴重影響。莖枯病的流行與降雨、風向有密切關系。雨水濺沾的傳染距離較近，是初期的侵染途徑。空氣傳染是大面積發病的主要原因，田間的蔓延方向和發病速度常受風向的影響。

地勢低洼、土質粘重的地區發病情況高于地勢高的砂質壤土地區，另外，過量偏施氮肥也會促使發病嚴重。不同品系的火龍果感病情況也不同，紅肉品系易感病，而白肉品系和粉紅色果肉品系不易感病。

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