荷花是古老的雙子葉植物之一，同時又具有單子葉植物的某些特征。荷花的胚芽被鱗片包裹著，和單子葉植物相似。從花的結構看，荷花具有3、4層花被，外輪萼片狀，內輪花瓣狀，雄蕊多數，雌蕊離生，花粉粒為單溝舟形。蓮的莖有明顯的分節現象，地下莖節長滿須根。這些都是單子葉植物的特征。荷花的芽為混合芽，人們所見的蓮芽，是藕的頂芽以及各節腋芽的位置。根分為種子根和不定根兩種，播種所出的由種子的胚根所形成的主根不發達，發揮功能作用的是不定根。荷花的莖就是藕，是荷花的地下根狀莖，是荷花儲藏養分和供繁殖的**。荷花的花單生，兩性，由花萼、花冠、雄蕊群、雌蕊群、花托、花柄等六部分組成。品種多樣，花色豐富。

荷花為竊根水生花卉。藕是荷花橫生于淤泥中的肥大地下莖。藕的橫斷面有許多大小不一的孔道，這是荷花為適應水中生活形成的氣腔。此種氣腔在葉柄、花梗里同樣可以見到。在莖上還有許多細小的運輸水分的導管，導管壁上附有增厚的粘液狀的木質纖維素。它具有一定的彈性，當折斷拉長時，使出現許多白色相連的藕絲。老藕的絲尤多于微藕。種藕的頂芽叫“藕苫”，被鱗片包著。它萌發后抽出白嫩細長的地下莖，稱為“藕帶”。藕帶分節，節的周圍環生不定根。節上抽葉和花。從藕帶先端形成的新藕叫主藕，旺盛者有4-7節藕筒，簡長10-25厘米，直徑約6-12厘米。主藕上分出支藕叫子藕；從子藕再長出的小蔥稱孫藕，常僅1節。藕的大小、形態、色澤、生藕的遲早、入泥深淺、品質風味等，均因品種而異，又受栽培和條件的影響。

荷花葉大，直徑可達70厘米，全線，呈盾狀圓形，具14-21條輻射狀葉脈。葉面深綠色、粗糙、滿布短小鈍刺。刺間有一層蠟質白粉，故能使雨水凝成滾動的水珠。葉背談綠，光潔無毛，脈隆起，中央有圓柱狀葉柄挺舉荷葉出水。柄上倒生較密剛刺，葉柄與地下莖相連處呈白色，水中及水上部分則為綠色。葉分三種：以頂芽初產生的葉，形小柄細，浮于水面，稱為錢葉，或叫荷錢；早從藕帶上長的葉略大，也浮于水面，叫浮葉；后來從藕帶上長的挺出水面的葉叫立葉。無論是錢葉、浮葉或立葉，出水前均相對內卷成棱條狀。立葉依生長早晚，其大小、高矮、順序表現出明顯的上升階梯和下降階梯。在新藕形成時抽出的立葉，比前張大而剛刺較短，叫“后把葉”，在其前方再出現一張形小、柄短、葉背微紅的葉，叫“終止葉”。人們只要辨別出終止葉，就能找到泥中新藕的方位。

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