牡丹除露地栽培外，還可以進行盆栽觀賞。栽植季節以9-10月為最好。盆栽牡丹應選擇適應性強、早開花、花型較好的洛陽紅、胡紅、趙粉等品種。植株宜選用芍藥作砧木嫁接的3-4年小棵牡丹或具有3-5個枝干的分株苗。盆栽時，盆底可用粗砂或小石子鋪3-5厘米厚，以利排水。盆土宜用黃砂土和餅肥的混合土，或用充分腐熟的廄肥、園土、粗砂以1：1：1的比例混勻的培養土。填土要使根系舒展，不能卷曲；覆土后要用手壓實，使根系與泥土緊密接觸，才易于成活。

    上盆后澆一次透水，放半陰處緩苗。轉入正常管理后，可放置向陽處，保證其有充分的陽光照射。生長期間要經常松土，每隔半個月左右施一次復合肥。新上盆的牡丹，不能施肥，特別忌施濃肥，否則肉質根會發霉爛死。半年后可逐漸施些薄肥，如腐熟的雞糞水或豆水等，肥水比例以20%-30%為宜。新上盆的牡丹第一年不一定能開出好花，但培養1-2年后，就能連年開花。牡丹一年在4月中、下旬開花，開花前可追施1-2次液肥；開花后半個月再追施1-2次液肥；伏天可用麻醬渣(每盆約40-50克)施1次干肥，以利花芽分化。
    牡丹系肉質根，稍能耐旱，最怕積水，故澆水是否得當，是盆栽牡丹成敗的一個關鍵問題。一般早春出室的牡丹，應先施一次肥水，然后澆透水，水稍干后松土。以后澆水應根據天氣、盆土情況，適時、適量進行，經常保持盆土濕潤，有利牡丹生長開花。合理的澆水，應該是見干見濕，不宜澆大水，防止盆內積水，以免爛根落葉。牡丹開花時，可設棚覆蓋或暫時放在室內，避免陽光直射，這樣可延長開花期，對主枝頂芽是葉芽的，應摘去，以免徒長，影響開花。
    為使牡丹開花鮮艷，花期可用0.5%-1%的磷酸二氫溶液進行葉面噴施2-3次。牡丹花謝后，要進行一次整形修剪，及時剪去殘花及花梗，不令結籽，保留莖部的1-2個外側芽，這樣可使植株生長旺盛，保證次年開花。牡丹雖然較耐寒，但在華北等寒冷的地區，立冬前后，應搬入室內，放在房間的向陽處，室溫保持0度左右即可。次年出室不宜過早，須待清明前后再出室。不太寒冷的地區，可選隱風處將花盆埋入土壤內，使盆面與地面平齊，以保持盆土的濕度和溫度，也可保證牡丹安全越冬。待第二年春天牡丹花現蕾后，再連盆將牡丹從地中挖出，進行正常管理。